病原微生物是指可以侵人體，在宿主中生長(zhǎng)繁殖、釋放毒性物質(zhì)等引起機(jī)體不同程度病理變化、發(fā)生感染的微生物，包括細(xì)菌、病毒、真菌、寄生蟲(chóng)、衣原體、支原體等。病原微生物檢測(cè)并非新領(lǐng)域，基于病原學(xué)證據(jù)的抗感染一直都是臨床診療的'金標(biāo)準(zhǔn)'。如果能盡早識(shí)別致病病原、啟動(dòng)恰當(dāng)?shù)目垢腥痉桨缚筛纳苹颊哳A(yù)后，尤其是重癥感染者。病原微生物檢測(cè)在感染判定中意義重大，越來(lái)越多的檢測(cè)技術(shù)引入臨床，除了傳統(tǒng)的檢測(cè)方法如涂片染色、培養(yǎng)分離、免疫學(xué)技術(shù)、核酸檢測(cè)等，還有新興的二代測(cè)序技術(shù)(Next-generationsequencing，NGS)等。

　　病原微生物檢測(cè)介紹病原體耐藥及毒力特征檢測(cè)：

　　在當(dāng)前的抗生素不規(guī)范使用以及宿主免疫等重重壓力下，病原體勢(shì)必在毒性以及耐藥方面有進(jìn)化。這種高毒性的以及高耐藥性的菌株往往是導(dǎo)致感染性疾病發(fā)病率、死亡率居高不下的重要原因。

　　臨床上耐藥性及毒性檢測(cè)方法主要是體外藥物敏感性試驗(yàn)、耐藥菌表型檢測(cè)等方法。這些方法操作繁瑣，且較費(fèi)時(shí)、費(fèi)力。NGS技術(shù)通量高、快速，在一次測(cè)序反應(yīng)中即可獲得細(xì)菌整個(gè)基因組的耐藥、毒力等相關(guān)基因信息，有助于揭示病原體毒力及耐藥機(jī)制，對(duì)臨床治療及指導(dǎo)用藥均具有重要意義。